經過新症.講解後，相信病人更了解接下來會發生的事，希望已準備好，接受接下來的治療。
正式治療時亦會發生不的事，往往病人都不太會知道正在發生甚麼事。正式治療過程中，放射治療師會進行對位、影像核對及開始治療等步驟。以下會講解更多細節。
治療對位
到正式治療時，放射治療師會找出病人身上的紋點，或是身上的線，以對準等中心點(Isocenter)。這一個點對應的位置通常是腫瘤的位置。因為直線加速器會圍著一個點而轉動，這個點，就是等中心點。也就是說，治療師會確保輻射能射到等中心點，即是腫瘤本身，以確保輻射可以殺滅癌細胞。
雖然病人可能有固定器，但因為每一次的位置都可能有少許不同，所以治療師會調整病友的位置，或是拉動你的身體，或是推腳等等，務求雷射線(laser)能對準身上的記號。
上述的圖片就展示了雷射線對位的工作。病人或會看到有些綠色或紅色的光線，記得不要直接望到那些雷射線。治療師會移動治療床，以對準身上的線或紋點。
病人只需要放鬆自己，如同模擬掃描一般，不需要刻意幫忙，已是最大的幫忙。有些病人往往太想幫手，卻不知治療師的實際想法，反而令位置差異愈來愈大。因此，放射治療師其中一句口頭禪，相信就是「不要動，放鬆。」。
影像核對(Verification)
有些醫院或會推動影像導向放射治療(Image-guided radiation therapy, IGRT)。這是在對準等中心點的前提下，以雙角度X光，甚或錐狀射束電腦斷層掃描(Cone-Beam Computed Tomography, CBCT) ，與當初電腦模擬掃描的影像及其產生的數字重建圖像(Digital Reconstructed Radiography, DRR)作對比。
放射治療的目標是病人能夠一樣的位置接受相同的治療。那麼，「一樣的位置」就是以一開始的電腦模擬掃描影像為標準。每次進行影像核對(Verification)時，都能計算出當下病人的影像與之前的影像差異多大。如果在可接受範圍內，則可以繼續治療。如果差異太大，有機會會控制治療床，以調節至當初的位置。
如果需要比較複雜的調整，放射治療師或會再進入治療室，仔細調整病人位置。因此，如果感覺到治療師出出入入，多數是為了調較位置。雖說病人的輻射量或會因額外的掃描而増加，但為了保每次治療都是準確，影像核對也是有其必要的。
然而，影像導向放射治療(IGRT)的代價就是整體的治療時間會較長，因為需要額外的步驟及時間完成影像核對。有時，如果病人的位置不能固定，影像核對的次數會多於一次，所用的時間也會更多。因此，在外等侯的病人也要對突然増加的等待時間體諒一二。
正式治療
完成影像核對後，治療會正式開始。病人會留在治療室內，一直躺在那裹，然後直線加速器會因應放射治療師的指示及先前的治療計劃，釋放出輻射，照射病人的腫瘤。這個過程沒有太大特別之處，因為每天也一樣。
而且，在電療過程中，病人也不會有特別感覺。只會聽到機器轉動的聲音。你也可能突然感覺到身下的治療床會有所移動，那是因為影像核對後的位置調整。不必感到驚慌，只需要保持不要動。因為影像核對是治療前的步驟，只能確保那一瞬間病人的位置是準確的。如果病人能保持著，那當然會一直準確。否則，那怕你的手指郁動，都可能會影響位置。
治療過程中，因為輻射的原因，所以治療師會離開治療室。雖然只有病人一人在治療室，但治療師會透過閉路電視，觀察著病人的情況。如遇上突發事，只需要舉手，甚或大叫，治療師都會馬上進來了解情況。因此，那怕病人單獨留在治療室中，仍是非常安全的。
因應治療設計的不同，正式治療時的時間都不盡相同。一般而言，愈多輻射線，劑量愈高，所需的時間都愈長。如果只計算釋放輻射的時間，其實不會多於5分鐘。其餘的時間就會用在機器調整，例如移動到某個角度及調較輻射能量等等。病人不必過於深究治療機下一步的行動是甚麼，只要保持不動，治療很快就會結束。
由於從頭到尾，放射治療都沒有特別感覺，因此有不少病人表示，當治療師入來扶他們起身時，才知道當天的治療己完成了。可見，治療本身並不會令病人有任何異樣，更不會有痛楚。反而最大的問題在於平躺後起來，那一刻可能會有點頭暈。
至於坊間所說的灼燒感，並不會在治療期間發生。輻射釋放的過程中，身體不會有任何感覺。全因輻射的存在不能被人體的感官所察覺到。各位病友自然不必多慮。
治療結束後
治療完成後，治療師會告訴你明天的治療時間。正如之前所提及到，記得留意時間，有機會未必與今日的相同。如有任何疑慮，要即時提出，以便治療師為你另作安排。
上述的步驟重複治療次數，就是整個放射治療的過程。頭一兩次或許有點緊張，但過多幾日，其實都沒有甚麼特別，自然會放鬆點。事實上，愈放鬆愈可以幫助病人渡過整個治療期，心情也會更舒服。
完成放射治療後，治療師會再提醒病人處理副作用的事宜。你也應該會得知覆診的日期，以檢驗治療效果，記緊依時出席就可以了。到了這一刻，整個放射治療就正式完結了。